De acuerdo con el artículo 38 del Reglamento de Rectoría, Rectoría Adjunta y Vicerrectorías, el artículo 37 inciso f) y 81 del Estatuto Orgánico, la Vicerrectoría de Administración justifica su organización por Programas, los cuales contarán con su propia estructura jerárquica, definición de cargos y denominación, los cuales estarán adscritos a esta.

Los programas que conforman la Vicerrectoría de Administración son: Programa de Gestión Financiera, Programa de Publicaciones e Impresiones, Programa Desarrollo de Recursos Humanos, Proveeduría Institucional, Programa de Servicios Generales y Programa de Desarrollo y Mantenimiento de la Infraestructura Institucional.